1. Tanah

a. Kantor Induk

Kantor Kesehatan Pelabuhan Kelas II Balikpapan berlokasi di Jl.Pelita RT.11 Kel.Sepinggan Raya Kec.Balikpapan Selatan (depan Bandara Sepinggan) Kota Balikpapan Selatan seluas 1000 M2.

b. Kantor Wilker Semayang

Di Jalan Yos Sudarso No.51 Jembatan 1 Balikpapan berada diatas tanah seluas 1.292 M2 di Wilayah Pelabuhan dekat tangki minyak milik PT.Pertamina (Persero). Sekarangan dijadikan Wilker yang ada di Lahan/Tanah milik PT. Pertamina (Persero) UP V Balikpapan.

c. Wilker Tanah Grogot

Kantor Wilker Tanah Grogot berada di Jl. Negara KM.12 Desa Pondong Baru Kec. Kuaro Kabupaten Pasir. Status tanah milik Pemerintah Daerah Kab. Pasir yang merupakan Pinjam pakai seluas 1000 m2.

d. Rumah Dinas

- Rumah Dinas Golongan I, berada di Jl. Martadinata Kel.Mekar Sari Balikpapan Luasnya tanah seluruhnya 243 m2 .

- Rumah Dinas Golongan II berada di Jl.DI.Pandjaitan Sumber Rejo Balikpapan luasnya tanah seluruhnya 73 m2

2. Gedung/Bangunan

Gedung Kantor Kesehatan Pelabuhan Kelas II Balikpapan adalah milik Kementerian Kesehatan dan dalam keadaan baik, yaitu diantaranya :

a. Gedung Kantor Induk di Jl.Pelita RT.11 Kel.Sepinggan Raya Kec.Balikpapan Selatan (depan Bandara Sepinggan) Kota Balikpapan Selatan.

b. Gedung Kantor Wilker Semayang di Jl. Yos Sudarso No.51 Jembatan 1 Balikpapan terdiri atas : Bangunan Tahun 1974, seluas 594 M2

Bangunan Tahun 1984, seluas 160 M2

c. Wilker Tanah Grogot Jl. Negara KM.12 Desa Pondong Baru Kec. Kuaro Kabupaten Pasir luas bangunan 125 M2.

d. Rumah Dinas Golongan I berada di Jl. Martadinata Kel. Mekar Sari Balikpapan Luasnya bangunan 70 m2

e. Rumah Dinas Golongan II berada di Jl. DI.Pandjaitan Sumber Rejo Balikpapan luasnya bangunan 50 m2\

3. Kendaraan Operasional

- Mobil Operasional ; 6 (enam) buah (1 buah kondisi rusak berat)

- Mobil Ambulance ; 7 (Tujuh) buah, (2 buah kondisi rusak berat berat)

- Sepeda Motor : 19 (sembilan belas) buah, (5 buah kondisinya rusak berat)

4. Peralatan Teknis

- Tenda Isolasi   : 1 (satu) buah

- Thermal Scanner   : 2 (dua) bauh

- Body Cleaner   : 1 (satu) buah

- Peralatan Pengendalian Risiko Lingkungan

- Perlatan Kekarantinaan

- Peralatan Pelayanan Kesehatan

- Peralatan Laboratorium